蛋白组与修饰组关联分析网络

应用场景

       在生物体内各种翻译后修饰过程不是孤立存在的，当某个关键蛋白发生修饰后，会影响与其直接相互作用的蛋白或导致通路上下游蛋白发生变化。蛋白互作网络是用于分析这一复杂生物过程的有效手段。

分析方法

       修饰组学与蛋白组学鉴定到的蛋白通过与STRING蛋白网络互作数据库比对后，提取confidence score > 0.7（high confidence）的蛋白集合互作关系，用Cytoscape软件对蛋白互作网络进行可视化。使用MCODE插件挖掘网络中具有高连通性的模块，进而对模块中的蛋白进行功能富集分析，标记出每个模块可能参与的关键生物过程。

图表展示

       注：蛋白组与修饰组关联分析网络。网络中的点代表蛋白，颜色代表蛋白发生修饰的类型，点的大小代表互作蛋白的个数。网络图中突出展示了两个高连通性的模块及其参与的生物功能。

参考文献

       An automated method for finding molecular complexes in large protein interaction network.